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兰州大学基础医学院前身为1932年12月成立的甘肃学院医学专修科的医学基础各教研室,现拥有甘肃省新药临床前研究重点实验室、17个教学科研基层组织和3个科学研究中心。
兰州大学基础医学院于2010年7月引进了迅数MF3多功能一体机,显微图像分析系统用于免疫组化研究,菌落计数仪用于病原微生物的生物学特性、致病性、耐药性等研究。